Taiki Kudou, um garoto da sétima série animada que sempre ajuda as pessoas em necessidade, encontra um Digimon chamado Shoutmon, que ele e seus amigos traz para o mundo digital. Com seus amigos Akari Hinomoto e Zenjirou Tsurugi, eles formam equipa Xros coração para competir contra equipes rivais que lutam pela supremacia, com seu objetivo final de derrubar o mal Bagura Empire, que pretende conquistar o Mundo Digital.